26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3535 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 279 aa  551  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  66.78 
 
 		 307 aa  345  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  51.65 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  51.76 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  49.61 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  50.38 
 
 		 288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  51.37 
 
 		 272 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  50 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  51.52 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  48.91 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  51.68 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  52.94 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  50.61 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  50.61 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  50.61 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  50.42 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  49.28 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  51.23 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  23.36 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  44.07 
 
 		 98 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  45.76 
 
 		 81 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  23.08 
 
 		 256 aa  45.8  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14960  phage shock protein A, PspA  22.97 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  24.1 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  21.55 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  22.64 
 
 		 263 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>