18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3183 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3183  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.104074  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1727  hypothetical protein  64.44 
 
 		 391 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00463945  hitchhiker  0.00188922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22500  hypothetical protein  44 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1618  hypothetical protein  42.64 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1097  hypothetical protein  39.68 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.481464  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1312  hypothetical protein  38.69 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1477  hypothetical protein  42.86 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000119083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2388  hypothetical protein  39.02 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3172  hypothetical protein  44.58 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5487  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.56 
 
 		 671 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12240  phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribonucleotide (ProFAR) isomerase  38.38 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134521  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1088  hypothetical protein  37.69 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0874  hypothetical protein  36.67 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379779  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2458  hypothetical protein  42.4 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1474  hypothetical protein  49.18 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6539  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  hitchhiker  0.00117101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2955  hypothetical protein  43.94 
 
 		 253 aa  52.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2212  hypothetical protein  40.62 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.903413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>