188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3089 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  100 
 
 
265 aa  530  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  66.27 
 
 
272 aa  319  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  55.78 
 
 
254 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  56.3 
 
 
254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  52.89 
 
 
253 aa  244  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  51.81 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  47.47 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  49.58 
 
 
255 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  45.71 
 
 
258 aa  218  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  48.52 
 
 
257 aa  208  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  47.62 
 
 
271 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  43.75 
 
 
270 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  41.7 
 
 
250 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  42.04 
 
 
249 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16110  esterase/lipase  43.67 
 
 
263 aa  169  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0607403  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  43.97 
 
 
257 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  40 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  40.57 
 
 
254 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1552  putative esterase/lipase  39.34 
 
 
262 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.431751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 
271 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  38.28 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13780  esterase/lipase  43.18 
 
 
256 aa  125  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0795828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  35.06 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  29.75 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
248 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
313 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  31.49 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  34.36 
 
 
257 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  25.64 
 
 
258 aa  106  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2956  carboxylesterase  26.78 
 
 
246 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000116225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  30.17 
 
 
253 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  31.12 
 
 
250 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5233  carboxylesterase  25.93 
 
 
246 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0438362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4957  carboxylesterase  25.93 
 
 
247 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000198319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  25.93 
 
 
247 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  25.93 
 
 
247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  25.93 
 
 
247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5335  carboxylesterase  25.93 
 
 
246 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00681619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  25.93 
 
 
247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  25.93 
 
 
247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1037  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
298 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  25.93 
 
 
247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  29.1 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4922  carboxylesterase  25.1 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00817956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  25.51 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  32.7 
 
 
277 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  25.42 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2473  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
253 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0084305  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  30.49 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  26.34 
 
 
227 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0205  carboxylesterase precursor  29.15 
 
 
238 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0953521  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  27.13 
 
 
733 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  24.81 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  27.59 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  23.32 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  29.63 
 
 
306 aa  89  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
241 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  27.13 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  30.91 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  30 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0449  carboxylesterase  24.28 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  31.98 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0843  hypothetical protein  28.74 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338238  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0912  hypothetical protein  29.8 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0547  putative carboxylesterase  33.63 
 
 
269 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312098 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
240 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
230 aa  82  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.67 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  30.77 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4397  carboxylesterase  29.65 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00786026  normal  0.386096 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  23.65 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  23.65 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3077  esterase/lipase-like  28.46 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2760  Esterase/lipase  33.63 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  27.76 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1174  hypothetical protein  26.32 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  32.06 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1813  putative carboxylesterase  28.24 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2291  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  26 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1054  esterase/lipase  26 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0969  thermostable monoacylglycerol lipase  26 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4387  esterase/lipase-like protein  26.61 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.77 
 
 
736 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5069  esterase/lipase-like  26.61 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5791  esterase/lipase-like protein  26.61 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.22 
 
 
736 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  31.22 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0393  esterase/lipase-like protein  28.85 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2553  alpha/beta hydrolase fold protein  40.7 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  25 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  28.42 
 
 
383 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>