18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0498 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0498  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  34.67 
 
 		 568 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  37.82 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  37.82 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  34.55 
 
 		 849 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  34.55 
 
 		 849 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0884  hypothetical protein  32.3 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3573  hypothetical protein  32.93 
 
 		 664 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0309383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4715  hypothetical protein  29.19 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  30.86 
 
 		 356 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  29.63 
 
 		 357 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  29.01 
 
 		 357 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  32.48 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  31.06 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  28 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  28 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  28 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4234  hypothetical protein  28.08 
 
 		 348 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.877652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>