32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3913 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 
238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  39.48 
 
 
208 aa  167  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  36.8 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  35.09 
 
 
232 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  34.21 
 
 
239 aa  121  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  33.89 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  31.91 
 
 
196 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  31.6 
 
 
207 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3299  putative urease accessory protein  32.65 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0670119  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  34.85 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  29.77 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  31.13 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  30.13 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  30.13 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  30.04 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  25.45 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  30.47 
 
 
222 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  27.91 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  23.65 
 
 
208 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0871  hypothetical protein  30.4 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390024  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  24.37 
 
 
219 aa  51.6  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14571  hypothetical protein  32.77 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0110  high-affinity nickel-transporter  31.29 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1528  hypothetical protein  31.06 
 
 
222 aa  48.9  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.862342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1049  high-affinity nickel-transporter  26.14 
 
 
374 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  26.4 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12871  nickel-transport integral membrane protein nicT  25.58 
 
 
372 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  44.19 
 
 
347 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2447  high-affinity nickel-transporter  26.27 
 
 
336 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000455077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3656  high affinity nickel transporter protein  27.41 
 
 
328 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1396  high-affinity nickel-transporter  24.89 
 
 
340 aa  42  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0483986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2577  high-affinity nickel-transporter  23.93 
 
 
347 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>