29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0771 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  100 
 
 
182 aa  360  6e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  39.13 
 
 
178 aa  110  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  29.94 
 
 
169 aa  84.7  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1046  Colicin V production protein  32.05 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  30.25 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  34.78 
 
 
161 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  32.31 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  25 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  27.34 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  22.22 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  29.03 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  29.69 
 
 
162 aa  48.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  25.54 
 
 
190 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  28.91 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  30 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  24.26 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  29.13 
 
 
191 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  30.58 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  25.99 
 
 
187 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  27.52 
 
 
162 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  31.09 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  29.75 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  20.62 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  24.18 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  24.84 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  25.62 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  25.41 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  25.42 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  24.44 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>