45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1034 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  100 
 
 		 128 aa  259  6.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  41.27 
 
 		 129 aa  91.3  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  37.98 
 
 		 125 aa  85.5  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  31.72 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  32.35 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  31.21 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  29.2 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  29.2 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  32.12 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  30.65 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  29.2 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  29.93 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  31.06 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  29.2 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  31.09 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  29.93 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  32.12 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  29.93 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  28.68 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  33.06 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  33.82 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  29.37 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  30.07 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  30.25 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  30.25 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  30.25 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  30.25 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  24.63 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  23.08 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  30.25 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  30.25 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  25.29 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  23.08 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  34.88 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  25.86 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  28.36 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  25 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  25 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  26.8 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  28.21 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  29.7 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1692  hypothetical protein  29.08 
 
 		 138 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>