264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1384 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1384  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
320 aa  669    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00346477  normal  0.552148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11020  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.22 
 
 
310 aa  518  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.244614  hitchhiker  0.000000479429 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00360  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  79.3 
 
 
373 aa  489  1e-137  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000113884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0693  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
304 aa  437  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.11795  hitchhiker  0.0000246007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.85 
 
 
308 aa  411  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.26 
 
 
323 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.62 
 
 
364 aa  411  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.22 
 
 
329 aa  404  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  64.21 
 
 
314 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.78 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
309 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.2 
 
 
301 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.84 
 
 
301 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.2 
 
 
301 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2954  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.05 
 
 
295 aa  401  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.19 
 
 
315 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.19 
 
 
318 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  67.03 
 
 
308 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.84 
 
 
301 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.2 
 
 
301 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.2 
 
 
301 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.84 
 
 
301 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.84 
 
 
301 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0017  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.2 
 
 
301 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.68 
 
 
301 aa  401  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
303 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.19 
 
 
335 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0069  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.26 
 
 
304 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.055597  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.26 
 
 
318 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.62 
 
 
317 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
315 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3869  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
303 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
315 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000378016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4857  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.09 
 
 
291 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.63 
 
 
317 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  66.19 
 
 
315 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.48 
 
 
327 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
315 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4370  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.33 
 
 
314 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1140  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.54 
 
 
303 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.34 
 
 
314 aa  394  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4038  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
303 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3850  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
303 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
304 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.12 
 
 
308 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
315 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  0.000000000112208 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
309 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3932  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
303 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.95 
 
 
306 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3292  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.25 
 
 
312 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.449402  normal  0.533286 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.99 
 
 
304 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3978  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
303 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.805  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3419  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.25 
 
 
312 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0042  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
304 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4168  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
304 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.63 
 
 
317 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.19 
 
 
315 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  0.00000000000895825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03411  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
303 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0151  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  66.55 
 
 
303 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0155  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
303 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.72 
 
 
301 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
317 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3965  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
303 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0022  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.48 
 
 
304 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.535702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
303 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.943552  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.77 
 
 
325 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.08 
 
 
301 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0111842  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1612  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.79 
 
 
329 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.119742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.19 
 
 
301 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.8 
 
 
317 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3762  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
303 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3099  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.92 
 
 
312 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal  0.928263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4055  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
303 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3783  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.48 
 
 
304 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03362  hypothetical protein  66.55 
 
 
303 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4131  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.48 
 
 
304 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.19 
 
 
301 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3330  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.8 
 
 
310 aa  391  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4935  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
303 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0951  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.35 
 
 
323 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2355  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.33 
 
 
315 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.121397 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.63 
 
 
319 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2348  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.68 
 
 
312 aa  387  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.89 
 
 
319 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4349  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.18 
 
 
318 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528511  decreased coverage  0.00159485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.77 
 
 
312 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1111  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.82 
 
 
322 aa  391  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.63 
 
 
312 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.63 
 
 
319 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0463  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.48 
 
 
320 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.7 
 
 
308 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2758  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.18 
 
 
313 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3983  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.07 
 
 
303 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1237  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62 
 
 
314 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.92 
 
 
318 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1093  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.16 
 
 
324 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.06 
 
 
287 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.67 
 
 
320 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>