23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0315 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0315  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0440166  hitchhiker  0.00820963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00248  hypothetical protein  99.15 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00251  hypothetical protein  99.15 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0299  hypothetical protein  99.15 
 
 		 236 aa  487  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0335  hypothetical protein  98.31 
 
 		 236 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218104  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3330  hypothetical protein  99.08 
 
 		 218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3315  conserved hypothetical protein  98.17 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  58.22 
 
 		 220 aa  261  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  30.73 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00254  hypothetical protein  29.29 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0338  hypothetical protein  31.28 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232796  normal  0.652539 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00251  hypothetical protein  29.29 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.391336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0302  hypothetical protein  29.59 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3312  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0318  hypothetical protein  30.73 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000777103  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3327  hypothetical protein  29.08 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  26.34 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  26.44 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  25.37 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  23.49 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  23.49 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  23.49 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4690  hypothetical protein  22.37 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00001791  hitchhiker  0.00000545566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>