19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2877 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2877  antirepressor protein  100 
 
 
334 aa  699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  64.36 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1718  hypothetical protein  47.57 
 
 
316 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000662496  unclonable  0.0000000124796 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2914  putative open reading frame  83.65 
 
 
226 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0105726  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3544  hypothetical protein  83.65 
 
 
224 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  hitchhiker  0.000000000055624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3142  anti-repressor protein Ant  64.35 
 
 
189 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.682869  hitchhiker  0.00000000668139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1530  anti-repressor protein Ant  64.35 
 
 
189 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1775  anti-repressor protein Ant  64.35 
 
 
189 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271275  normal  0.0239228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2253  anti-repressor protein Ant  64.35 
 
 
189 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000406549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3525  anti-repressor protein Ant  62.39 
 
 
189 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860875  hitchhiker  0.000134642 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  74.75 
 
 
335 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2424  anti-repressor protein Ant  39.9 
 
 
315 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3322  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  95.9  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5403  hypothetical protein  35.9 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.286654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0815  hypothetical protein  26.52 
 
 
206 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2871  hypothetical protein  26.52 
 
 
206 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000371637  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0655  KilA, N- domain protein  22.54 
 
 
284 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.243495  hitchhiker  0.00000329473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0323  hypothetical protein  25.49 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.161575  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0652  gp30  30 
 
 
212 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  hitchhiker  0.0000154147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>