14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2424 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2424  anti-repressor protein Ant  100 
 
 		 315 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1530  anti-repressor protein Ant  49.69 
 
 		 189 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1775  anti-repressor protein Ant  49.69 
 
 		 189 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271275  normal  0.0239228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2253  anti-repressor protein Ant  49.69 
 
 		 189 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000406549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3142  anti-repressor protein Ant  49.69 
 
 		 189 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.682869  hitchhiker  0.00000000668139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3525  anti-repressor protein Ant  52.41 
 
 		 189 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860875  hitchhiker  0.000134642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2877  antirepressor protein  39.9 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1718  hypothetical protein  39.59 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000662496  unclonable  0.0000000124796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3322  hypothetical protein  45.31 
 
 		 183 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5403  hypothetical protein  36.64 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.286654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  27.31 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1739  hypothetical protein  27.13 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.326437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2796  hypothetical protein  26.36 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0847  hypothetical protein  26.17 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000160526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>