15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2253 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1530  anti-repressor protein Ant  100 
 
 
189 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1775  anti-repressor protein Ant  100 
 
 
189 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271275  normal  0.0239228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2253  anti-repressor protein Ant  100 
 
 
189 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000406549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3142  anti-repressor protein Ant  100 
 
 
189 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.682869  hitchhiker  0.00000000668139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3525  anti-repressor protein Ant  94.71 
 
 
189 aa  380  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860875  hitchhiker  0.000134642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2877  antirepressor protein  64.35 
 
 
334 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2424  anti-repressor protein Ant  49.69 
 
 
315 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3322  hypothetical protein  54.29 
 
 
183 aa  131  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1718  hypothetical protein  48.74 
 
 
316 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000662496  unclonable  0.0000000124796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5403  hypothetical protein  38.14 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.286654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1739  hypothetical protein  30.1 
 
 
277 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.326437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0815  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2871  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000371637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2796  hypothetical protein  30.1 
 
 
277 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0847  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000160526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>