14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0446 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  98.09 
 
 		 2907 bp  2016    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3235    98 
 
 		 4168 bp  2008    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  97.18 
 
 		 1398 bp  1937    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  98 
 
 		 2769 bp  2008    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  98.98 
 
 		 3003 bp  2415    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  97.37 
 
 		 2145 bp  1953    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  97.37 
 
 		 1197 bp  1953    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  89.25 
 
 		 1413 bp  1241    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  88.79 
 
 		 2607 bp  1219    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  87.23 
 
 		 3012 bp  1231    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  88.66 
 
 		 2043 bp  1213    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  88.52 
 
 		 2046 bp  1195    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0446    100 
 
 		 1500 bp  2974    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  98.09 
 
 		 2907 bp  2016    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>