20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1706 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  634    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  59.16 
 
 		 327 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  53.85 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  45.85 
 
 		 330 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  48.94 
 
 		 325 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  44.86 
 
 		 341 aa  245  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  39.26 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  37.01 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  39.86 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  37.7 
 
 		 353 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  39.54 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  22.44 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  28.05 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  20.65 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  36.63 
 
 		 143 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0185  nucleoside recognition domain protein  29.85 
 
 		 154 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0110  nucleoside recognition domain protein  28.03 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.350312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08280  nucleoside recognition domain protein  31.62 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  27.78 
 
 		 148 aa  53.9  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  30.36 
 
 		 137 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>