16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0627 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0627  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  44.02 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2568  hypothetical protein  32.26 
 
 		 284 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  32.93 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  28.73 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  29.25 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  30.49 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  29.25 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  27.95 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  30.38 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4154  hypothetical protein  29.09 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  30 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  29.45 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  30.52 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  28.49 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0852  Terminase small subunit  24.34 
 
 		 291 aa  41.2  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000936186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>