19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0472 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0472  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  650    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0337887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1544  Zinc finger-domain-containing protein  51.08 
 
 		 262 aa  275  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2111  hypothetical protein  68.53 
 
 		 256 aa  202  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0575068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1439  MJ0042 family finger-like protein  58.99 
 
 		 239 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  35.48 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0863  MJ0042 family finger-like protein  54.48 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.305233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  35.81 
 
 		 560 aa  95.9  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  28.57 
 
 		 547 aa  87.8  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  29.27 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2710  hypothetical protein  29.21 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  35 
 
 		 707 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  35 
 
 		 694 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  32.77 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  28.87 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  28.81 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  26.92 
 
 		 635 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  42.86 
 
 		 1124 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  29.41 
 
 		 554 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>