69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3397 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3397  putative lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 171 aa  350  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4052  putative lipoprotein transmembrane  97.66 
 
 		 171 aa  342  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0832  putative lipoprotein transmembrane  75.35 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4689  putative lipoprotein transmembrane  53.38 
 
 		 167 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5112  putative lipoprotein transmembrane  38.46 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1356  hypothetical protein  42.54 
 
 		 172 aa  90.9  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0388  putative lipoprotein transmembrane  38.97 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1374  putative lipoprotein transmembrane  37.59 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1438  lipoprotein transmembrane  38.58 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.565531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0268  putative lipoprotein transmembrane  42.62 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2071  hypothetical protein  33.83 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4200  transmembrane protein  33.54 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3500  hypothetical protein  35.56 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0357475  normal  0.416536 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1899  hypothetical protein  33.83 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  0.292321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4572  putative transmembrane protein  35.56 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.686255  normal  0.728328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1480  lipoprotein transmembrane  36.84 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.028098  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2222  putative transmembrane protein  33.83 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1336  putative lipoprotein  33.13 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130729  normal  0.043389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3222  putative lipoprotein  32.68 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0954  lipoprotein transmembrane  32.24 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0673  lipoprotein  33.61 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6448  putative lipoprotein  31.88 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.961477  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  34.31 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.35893 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1174  hypothetical protein  34.15 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2016  putative lipoprotein  32.41 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0546155  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0695  hypothetical protein  34.15 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2173  hypothetical protein  33.09 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2280  hypothetical protein  33.09 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282799  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2130  hypothetical protein  34.15 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.657299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1021  hypothetical protein  32.37 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4746  lipoprotein transmembrane  33.6 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1644  hypothetical protein  33.09 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2294  hypothetical protein  32.37 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075396  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2256  hypothetical protein  33.09 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2854  putative lipoprotein  34.13 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5584  hypothetical protein  32.37 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60834  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1056  hypothetical protein  32.54 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1053  hypothetical protein  32.54 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4286  hypothetical protein  32.54 
 
 		 185 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0919  hypothetical protein  28.21 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.600843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5584  hypothetical protein  32.65 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1053  putative lipoprotein  32.37 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000833656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1282  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1289  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0745  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0404  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1838  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1121  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3111  hypothetical protein  33.08 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1427  putative lipoprotein  31.65 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2770  hypothetical protein  30.33 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.172738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4094  hypothetical protein  36.59 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2382  lipoprotein  30.83 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2595  putative lipoprotein  34.13 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2191  lipoprotein  31.75 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.768986  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1794  putative lipoprotein  30.16 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2929  putative lipoprotein  30.7 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1552  putative lipoprotein  29.82 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3837  hypothetical protein  30.5 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139182  normal  0.877225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1840  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0582073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4089  putative lipoprotein  30.89 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0047  hypothetical protein  27.55 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0604  lipoprotein  28.12 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2813  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3490  putative lipoprotein  27.22 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0605  hypothetical protein  27.27 
 
 		 207 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>