15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2172 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  339  9e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2691  hypothetical protein  89.22 
 
 		 203 aa  313  9e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0293  hypothetical protein  50.3 
 
 		 205 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0066  hypothetical protein  49.7 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5327  hypothetical protein  59.43 
 
 		 133 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5146  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.630327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1961  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0685791  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  29.34 
 
 		 198 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  31.16 
 
 		 198 aa  48.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  36.73 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  36.73 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  31.68 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  30.88 
 
 		 237 aa  40.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>