238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0990 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1074  bacterioferritin  100 
 
 
160 aa  328  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434507  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0990  bacterioferritin  100 
 
 
160 aa  328  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2757  bacterioferritin  82.28 
 
 
158 aa  272  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738013  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1507  bacterioferritin  76.13 
 
 
159 aa  248  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1283  bacterioferritin  71.79 
 
 
162 aa  231  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815462  normal  0.472736 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01151  bacterioferritin  71.14 
 
 
165 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0865  bacterioferritin  69.28 
 
 
154 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09160  bacterioferritin  69.28 
 
 
154 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4721  bacterioferritin  67.32 
 
 
154 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0482  bacterioferritin  67.32 
 
 
154 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0515  bacterioferritin  67.32 
 
 
154 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0679585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0511  bacterioferritin  66.67 
 
 
154 aa  210  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150479  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3880  bacterioferritin  65.36 
 
 
154 aa  208  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0653  bacterioferritin  66.01 
 
 
154 aa  207  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4521  bacterioferritin  64.71 
 
 
154 aa  204  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642969  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5052  bacterioferritin  64.52 
 
 
155 aa  204  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10050  bacterioferritin protein  64.05 
 
 
154 aa  199  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618256  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1384  bacterioferritin  58.13 
 
 
162 aa  187  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2114  bacterioferritin  58.23 
 
 
159 aa  184  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1077  ferritin:bacterioferritin  58.23 
 
 
162 aa  184  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139302  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1167  bacterioferritin, subunit 1  55.13 
 
 
161 aa  171  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2529  bacterioferritin subunit 1  53.25 
 
 
156 aa  169  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2835  bacterioferritin  54.14 
 
 
157 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0233264 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02052  bacterioferritin subunit 1  53.9 
 
 
155 aa  168  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000533514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  53.9 
 
 
155 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0958  bacterioferritin  54.55 
 
 
155 aa  167  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.874895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1062  bacterioferritin  55.13 
 
 
161 aa  166  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  53.25 
 
 
155 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0991  bacterioferritin  52.6 
 
 
155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  53.25 
 
 
155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3094  bacterioferritin  51.95 
 
 
155 aa  164  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  51.95 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0636  bacterioferritin  55.84 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.554542  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3607  bacterioferritin  51.95 
 
 
155 aa  161  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300979  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3429  bacterioferritin  51.3 
 
 
155 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0282624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0949  bacterioferritin  51.3 
 
 
155 aa  160  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3357  bacterioferritin  51.3 
 
 
155 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313026  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2872  bacterioferritin  54.55 
 
 
155 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3554  bacterioferritin  51.3 
 
 
155 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0933  bacterioferritin  50.65 
 
 
155 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2075  bacterioferritin  51.95 
 
 
155 aa  158  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  54.19 
 
 
159 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  48.41 
 
 
160 aa  148  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  50.97 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  48.05 
 
 
156 aa  134  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  48.08 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  44.94 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  44.94 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  43.04 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  44.3 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  45.45 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  48.05 
 
 
156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  46.15 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  44.94 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  45.51 
 
 
157 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  44.94 
 
 
158 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  44.3 
 
 
224 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  45.51 
 
 
157 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  44.03 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  46.75 
 
 
158 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  43.59 
 
 
159 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  44.3 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  40.51 
 
 
158 aa  123  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  45.45 
 
 
158 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  45.45 
 
 
158 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  46.1 
 
 
158 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  45.45 
 
 
158 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  45.45 
 
 
158 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  45.75 
 
 
158 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  45.45 
 
 
158 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  45.75 
 
 
158 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  44.1 
 
 
160 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  42.41 
 
 
158 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  43.31 
 
 
159 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  44.81 
 
 
157 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  46.75 
 
 
159 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  44.81 
 
 
158 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  44.81 
 
 
158 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  42.68 
 
 
159 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  44.81 
 
 
158 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  44.81 
 
 
158 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  44.81 
 
 
158 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  46.75 
 
 
159 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  44.81 
 
 
157 aa  121  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  45.45 
 
 
172 aa  120  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  46.1 
 
 
158 aa  120  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  44.03 
 
 
158 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  44.16 
 
 
157 aa  120  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  45.51 
 
 
158 aa  120  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  43.51 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  44.23 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  44.81 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>