50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0189 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  100 
 
 		 156 aa  320  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  98.08 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  54.55 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  36.02 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  34.23 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  39.1 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  38.06 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  39.1 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  38.71 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  38.46 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  34.42 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  35.06 
 
 		 174 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  36.18 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  36.3 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  36.3 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  36.55 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  34.94 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  36.18 
 
 		 146 aa  89  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  30.82 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  31.45 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  32.7 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  31.45 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  35.29 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  30.82 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  30.82 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  30.82 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  30.19 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  30.82 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  33.08 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  33.33 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  28.93 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  31.58 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  27.78 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  31.97 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  27.81 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  30.46 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  25.49 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  27.27 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  28.21 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  29.35 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  28.99 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  26.32 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  24.32 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1692  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  23.08 
 
 		 128 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  26.09 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  28.29 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  26.75 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>