15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4358 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4358  Colicin V production protein  100 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  25.43 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2220  colicin V production protein  25.36 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  27.39 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  22.29 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  21.64 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  25.17 
 
 		 162 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  23.78 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1973  CvpA family protein  28.78 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  24.84 
 
 		 163 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  21.72 
 
 		 158 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  21.47 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  23.62 
 
 		 159 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  24.47 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  38.6 
 
 		 162 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>