66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2156 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.89 
 
 		 297 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.89 
 
 		 297 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.89 
 
 		 297 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1693  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.07 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.85 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.5 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.34 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3578  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.29 
 
 		 298 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.674001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.63 
 
 		 299 aa  362  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.15 
 
 		 300 aa  361  9e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.19 
 
 		 298 aa  358  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.98 
 
 		 321 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.67 
 
 		 306 aa  354  8.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.982462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.13 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.15 
 
 		 298 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3550  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.07 
 
 		 300 aa  352  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.36 
 
 		 296 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.7 
 
 		 296 aa  349  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.07 
 
 		 295 aa  346  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.49 
 
 		 293 aa  340  2e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0340  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.59 
 
 		 295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0085  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.64 
 
 		 296 aa  331  7.000000000000001e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.249059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.9 
 
 		 296 aa  329  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.9 
 
 		 296 aa  329  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.06 
 
 		 294 aa  326  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.24 
 
 		 296 aa  324  9e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2273  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.99 
 
 		 296 aa  324  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42447  cytosolic aldolase  53.95 
 
 		 299 aa  323  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134793  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.86 
 
 		 296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.47 
 
 		 299 aa  312  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  51.39 
 
 		 296 aa  291  9e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  31.25 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  27.56 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  27.11 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  28.57 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  29.73 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  27.65 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  32.97 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  27.15 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.61 
 
 		 355 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  26.58 
 
 		 348 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  25.59 
 
 		 401 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  31.11 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  31.11 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  28.69 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  26.79 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  29.72 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  27.87 
 
 		 343 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  26.57 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  27.62 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  28.09 
 
 		 340 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  28 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  31.71 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.71 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  29.48 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  28.14 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  25.68 
 
 		 344 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  25 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  27.3 
 
 		 341 aa  45.8  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  27.24 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  30.29 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  27.7 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  28.97 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  26.98 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  26.96 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>