78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1343 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1343  Sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 74 aa  144  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.139725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1797  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  74.67 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00956825  normal  0.0641445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1983  twin arginine-targeting protein translocase  71.62 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.830772  normal  0.0374127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2540  twin-arginine translocation system protein, TatA  70.27 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.540586  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1199  twin arginine-targeting protein translocase  70.27 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0780596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1209  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  64.56 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0907  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  79.66 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4481  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3102  Sec-independent protein translocase TatE  67.39 
 
 		 63 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.101906  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3830  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  67.39 
 
 		 63 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  40.28 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  48.89 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  39.71 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  46.3 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  43.14 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  43.14 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  43.14 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  36.99 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  43.14 
 
 		 79 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  38.16 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  42.55 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  51.16 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  37.33 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.82 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  32.94 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  35.62 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  33.75 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  32.5 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  31.51 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.5 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  32.5 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  32.5 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  42 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  68.97 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  37.14 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  43.64 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  37.68 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  37.68 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  28.77 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  29.17 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  43.75 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  62.07 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  28.77 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  28.77 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  38.36 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  31.58 
 
 		 96 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2971  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.82 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00309368  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1487  twin arginine translocase protein A  51.22 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  52.5 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1020  Sec-independent protein translocase protein tatA, putative  31.67 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.29 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  30.86 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1685  twin arginine translocase protein A  40.98 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  44.9 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  29.63 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  29.85 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  30.77 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  33.8 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  36.84 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.71 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  28 
 
 		 92 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  29.41 
 
 		 90 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  28.95 
 
 		 88 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>