More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0216 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0216  electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
308 aa  603  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0545  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  85.71 
 
 
308 aa  474  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2426  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  83.44 
 
 
309 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  77.92 
 
 
308 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2551  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  81.82 
 
 
308 aa  454  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147723  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  77.92 
 
 
308 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  77.92 
 
 
308 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.03 
 
 
314 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  67.42 
 
 
314 aa  394  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.34 
 
 
313 aa  394  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.08 
 
 
309 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.48 
 
 
309 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  66.45 
 
 
311 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  65.48 
 
 
309 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.48 
 
 
309 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.05 
 
 
317 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.08 
 
 
309 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.13 
 
 
309 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.4 
 
 
309 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.48 
 
 
349 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  69.03 
 
 
314 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2158  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.05 
 
 
314 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149461  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.84 
 
 
309 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.81 
 
 
308 aa  362  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.87 
 
 
309 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0820  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.27 
 
 
316 aa  361  9e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0931  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.56 
 
 
316 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3480  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.1 
 
 
314 aa  360  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95014  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.23 
 
 
309 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.87 
 
 
319 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  63.64 
 
 
309 aa  358  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.64 
 
 
309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3034  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.55 
 
 
309 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.43 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.81 
 
 
308 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.23 
 
 
309 aa  353  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.18 
 
 
312 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.32 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.91 
 
 
307 aa  352  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.87 
 
 
309 aa  352  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.84 
 
 
308 aa  351  7e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  61.89 
 
 
309 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.33 
 
 
308 aa  350  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.9 
 
 
309 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.7 
 
 
311 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.38 
 
 
311 aa  348  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1038  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.77 
 
 
309 aa  348  9e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.434498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.49 
 
 
308 aa  347  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  59.49 
 
 
310 aa  347  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3855  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.95 
 
 
313 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.61 
 
 
308 aa  346  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.77 
 
 
310 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.23 
 
 
310 aa  345  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  63.57 
 
 
327 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.06 
 
 
310 aa  344  8.999999999999999e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  62.93 
 
 
309 aa  343  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.84 
 
 
308 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.55 
 
 
309 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.71 
 
 
309 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.41 
 
 
311 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.29 
 
 
311 aa  342  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.39 
 
 
307 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.34 
 
 
310 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.5 
 
 
317 aa  341  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.41 
 
 
311 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60 
 
 
313 aa  340  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.09 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.29 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.09 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  61.09 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.09 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.41 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.09 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.09 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.41 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  62.26 
 
 
309 aa  339  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.41 
 
 
311 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.9 
 
 
308 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.09 
 
 
311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.41 
 
 
311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.09 
 
 
311 aa  338  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.74 
 
 
311 aa  337  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.77 
 
 
311 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.45 
 
 
310 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  59.81 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.9 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  56.09 
 
 
312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.22 
 
 
308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  61.09 
 
 
311 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.33 
 
 
309 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.25 
 
 
307 aa  335  5e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  63.23 
 
 
309 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.17 
 
 
307 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  62.26 
 
 
309 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.58 
 
 
308 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  55.77 
 
 
312 aa  334  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.13 
 
 
313 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.93 
 
 
309 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  60.63 
 
 
315 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1289  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.61 
 
 
311 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.398679  normal  0.0814706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>