17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2113 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2113  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  38.96 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2319  hypothetical protein  29.81 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  26.89 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  25.68 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  33.06 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  24.47 
 
 		 418 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  30.77 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  24.32 
 
 		 423 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  23.11 
 
 		 423 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  23.11 
 
 		 423 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  40 
 
 		 412 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  23.11 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  29.34 
 
 		 407 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  23.11 
 
 		 423 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  21.97 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  35.8 
 
 		 424 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>