45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0587 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0587  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  294  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  85.26 
 
 
239 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  50.54 
 
 
240 aa  103  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  44.57 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  43.48 
 
 
254 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  39.58 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.08 
 
 
232 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.05 
 
 
232 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  35.96 
 
 
636 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 
579 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  37.36 
 
 
271 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  36.46 
 
 
259 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15841  hypothetical protein  35.87 
 
 
296 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1568  hypothetical protein  35.16 
 
 
271 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  32.97 
 
 
271 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  33.33 
 
 
681 aa  53.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0233  hypothetical protein  36.96 
 
 
264 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1343  hypothetical protein  32.97 
 
 
271 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2290  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
253 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0619  metallophosphoesterase  32.97 
 
 
265 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  25.47 
 
 
595 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.63 
 
 
223 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  36.62 
 
 
244 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3084  metallophosphoesterase  32.39 
 
 
244 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
271 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.56 
 
 
222 aa  47  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5252  metallophosphoesterase  28.72 
 
 
244 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3115  metallophosphoesterase  28.72 
 
 
244 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  37.18 
 
 
222 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5021  metallophosphoesterase  28.72 
 
 
244 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4135  metallophosphoesterase  34.21 
 
 
268 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0557704  hitchhiker  0.00370381 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04180  hypothetical protein  25.53 
 
 
274 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.77 
 
 
222 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3589  metallophosphoesterase  32.53 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242712  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1085  metallophosphoesterase  37.5 
 
 
243 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.307111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5408  metallophosphoesterase  32.89 
 
 
247 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0090  metallophosphoesterase  25.61 
 
 
263 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5140  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
244 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157126  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  25.96 
 
 
233 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.89 
 
 
219 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3461  metallophosphoesterase  26.88 
 
 
244 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122821  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2851  metallophosphoesterase  36.47 
 
 
247 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00538078  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1634  hypothetical protein  26.21 
 
 
316 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0401  metallophosphoesterase  24.24 
 
 
244 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1612  putative phosphatase  23.42 
 
 
268 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.481085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>