36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0523 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  100 
 
 
743 aa  1526    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2107  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 
760 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.49 
 
 
729 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  24.78 
 
 
821 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  23.61 
 
 
712 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  26.38 
 
 
795 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  26.85 
 
 
790 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.09 
 
 
827 aa  84.7  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  29.96 
 
 
570 aa  81.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0512  hypothetical protein  25.94 
 
 
835 aa  79.7  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0576205  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1970  hypothetical protein  26.53 
 
 
738 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0499  hypothetical protein  23.62 
 
 
755 aa  69.3  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0510016  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3795  hypothetical protein  22.77 
 
 
740 aa  68.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.542831  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1252  subtilisin-like serine protease  28.57 
 
 
751 aa  64.7  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.950247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0295  hypothetical protein  30.8 
 
 
425 aa  63.9  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0359768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3739  hypothetical protein  25 
 
 
740 aa  63.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5697  hypothetical protein  24.3 
 
 
737 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2443  hypothetical protein  24.91 
 
 
739 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  22.61 
 
 
792 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  33.33 
 
 
1351 aa  56.6  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.57 
 
 
1060 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1065  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 
442 aa  51.6  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00635  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.52 
 
 
742 aa  51.2  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617158  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  21.5 
 
 
814 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.58 
 
 
1269 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00227645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  22.7 
 
 
869 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2098  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.18 
 
 
744 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  24.4 
 
 
872 aa  47.8  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1596  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 
1262 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1082  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.36 
 
 
743 aa  46.6  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  22.9 
 
 
829 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
986 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1671  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.91 
 
 
1262 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0114197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  29.03 
 
 
1285 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2457  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.38 
 
 
678 aa  44.3  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  23.92 
 
 
823 aa  44.3  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>