13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0298 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0298  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1111    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0911  hypothetical protein  28.65 
 
 		 561 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00412972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3702  hypothetical protein  36.28 
 
 		 244 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  36.47 
 
 		 566 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  30.77 
 
 		 606 aa  47  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  30.43 
 
 		 756 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  29.79 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  33.33 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  27.73 
 
 		 738 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  26.67 
 
 		 730 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  29.01 
 
 		 773 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  31.08 
 
 		 485 aa  44.3  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0086  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 633 aa  43.9  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.243153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>