25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0107 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
347 aa  683    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  52.02 
 
 
248 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  43.37 
 
 
301 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  35.57 
 
 
220 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  28.57 
 
 
563 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0886  hypothetical protein  34.55 
 
 
259 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3197  PRC-barrel domain-containing protein  29.94 
 
 
184 aa  89.4  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0772217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3233  hypothetical protein  28.75 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0459  hypothetical protein  26.98 
 
 
268 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2564  hypothetical protein  30.3 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3578  hypothetical protein  28.85 
 
 
164 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0227988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1850  PRC-barrel domain-containing protein  27.95 
 
 
159 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1649  hypothetical protein  29.66 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0145454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3061  hypothetical protein  29.75 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.488038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3262  PRC-barrel domain-containing protein  26.54 
 
 
230 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2494  PRC-barrel domain protein  24.53 
 
 
157 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1194  PRC-barrel domain protein  25.73 
 
 
178 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03251  hypothetical protein  28 
 
 
369 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05720  PRC-barrel domain protein  24.32 
 
 
161 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.443895  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0424  hypothetical protein  25.14 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.668376  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2256  hypothetical protein  24.58 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01221  hypothetical protein  30.08 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2589  hypothetical protein  29.2 
 
 
143 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000783955  hitchhiker  0.00142136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  27.69 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018855 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1421  PRC-barrel domain-containing protein  29.27 
 
 
346 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>