More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3225 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  100 
 
 
411 aa  804    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  53.94 
 
 
411 aa  418  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  49.5 
 
 
397 aa  360  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  47.06 
 
 
401 aa  345  7e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  47.03 
 
 
402 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  48.51 
 
 
402 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  42.86 
 
 
411 aa  293  4e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  42.22 
 
 
424 aa  292  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  40.78 
 
 
422 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  40.68 
 
 
423 aa  289  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  41.61 
 
 
423 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  40.39 
 
 
422 aa  285  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  42.65 
 
 
423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  41.16 
 
 
417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  40.92 
 
 
417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  39.9 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  39.9 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  39.9 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  39.9 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  41.56 
 
 
422 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  40.99 
 
 
422 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  41.02 
 
 
422 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  40.15 
 
 
429 aa  279  8e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  40.15 
 
 
422 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  39.66 
 
 
429 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  40.59 
 
 
422 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  39.66 
 
 
429 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  41.4 
 
 
419 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  41.15 
 
 
433 aa  275  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  39.66 
 
 
429 aa  275  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  40.99 
 
 
422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  41.81 
 
 
422 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  40.65 
 
 
419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  41.58 
 
 
422 aa  269  7e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  39.9 
 
 
428 aa  266  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  40.29 
 
 
423 aa  265  8e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  41.09 
 
 
418 aa  262  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  42.75 
 
 
423 aa  262  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  41.81 
 
 
416 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  40.14 
 
 
431 aa  255  8e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  36.17 
 
 
417 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  35.95 
 
 
417 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  39.6 
 
 
421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  40.53 
 
 
524 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  40.24 
 
 
418 aa  237  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  40 
 
 
514 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  36.07 
 
 
429 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  37.18 
 
 
420 aa  232  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  39.74 
 
 
523 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  37.72 
 
 
542 aa  219  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  36.81 
 
 
426 aa  211  2e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  40.27 
 
 
498 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  37.68 
 
 
504 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  37.25 
 
 
500 aa  207  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  37.44 
 
 
494 aa  206  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  36.74 
 
 
505 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  40.52 
 
 
549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  36.5 
 
 
505 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  38.68 
 
 
526 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  34.41 
 
 
501 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  39.62 
 
 
499 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  38.89 
 
 
502 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  39.07 
 
 
499 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  37.5 
 
 
496 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  38.04 
 
 
535 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  39.01 
 
 
520 aa  190  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  38.13 
 
 
521 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  39.04 
 
 
494 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  46.7 
 
 
346 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0998  hypothetical protein  29.98 
 
 
399 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.06049  normal  0.558836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  29.14 
 
 
333 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  27.98 
 
 
391 aa  146  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  33.98 
 
 
474 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1021  phosphate transporter  28.82 
 
 
391 aa  142  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.335253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  27.79 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  48.43 
 
 
535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  42.31 
 
 
512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_32  phosphate/sulfate transporter, PiT family  28.05 
 
 
333 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  43.09 
 
 
535 aa  137  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0034  phosphate transporter  28.5 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.81002  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  43.32 
 
 
535 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  46.67 
 
 
516 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  41.08 
 
 
514 aa  136  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0031  phosphate transporter  28.54 
 
 
333 aa  135  9e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.952576  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  39.34 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  39.34 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  38.8 
 
 
508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  28.78 
 
 
336 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  26.4 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1038  phosphate transporter  31.16 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  40 
 
 
461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  42.07 
 
 
506 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  28.17 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  39.53 
 
 
599 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  28.57 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  37.37 
 
 
497 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1631  phosphate transporter  34.27 
 
 
521 aa  123  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11011  conserved hypothetical protein  39.87 
 
 
558 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1443  phosphate transporter  26.46 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315159  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  39.41 
 
 
522 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>