28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2386 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2386  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4040  hypothetical protein  46.03 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.344476  normal  0.247596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  35.51 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  37.96 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2112  hypothetical protein  32.94 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0484035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 219 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70050  hypothetical protein  34.23 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6079  hypothetical protein  34.23 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4712  hypothetical protein  29.51 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  30.56 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1190  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1847  hypothetical protein  31.82 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2700  hypothetical protein  29.41 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2262  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0018871  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1119  hypothetical protein  29.92 
 
 		 115 aa  43.9  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331075  normal  0.672646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1568  hypothetical protein  27.06 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1912  hypothetical protein  28.24 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000806224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  31.73 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1085  hypothetical protein  31.76 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1470  hypothetical protein  25.88 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2272  hypothetical protein  25.88 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01368  hypothetical protein  25.88 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01355  hypothetical protein  25.88 
 
 		 108 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0620  hypothetical protein  31.17 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1634  hypothetical protein  31.76 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4964  hypothetical protein  36.14 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1204  hypothetical protein  32.58 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0387991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>