15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1847 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1847  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2263  hypothetical protein  45.66 
 
 
221 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2057  hypothetical protein  45.63 
 
 
215 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.61139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1053  hypothetical protein  44.44 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2567  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087553 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1103  hypothetical protein  29.01 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148506  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1599  hypothetical protein  33.86 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.114098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0986  hypothetical protein  30.3 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.628076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2111  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1407  hypothetical protein  45.28 
 
 
77 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0820  hypothetical protein  27.22 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0532  hypothetical protein  29.92 
 
 
208 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0304  hypothetical protein  26.54 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1009  hypothetical protein  31.39 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3621  hypothetical protein  28.8 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.537291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>