164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3004 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  100 
 
 		 459 aa  952    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  49.89 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  48.93 
 
 		 472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  49.36 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  48.5 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  48.93 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  48.71 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  48.71 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  48.93 
 
 		 470 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  47.97 
 
 		 470 aa  461  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  48.93 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  48.5 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  48.5 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  48.93 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  49.67 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  46.72 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  48.41 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  47.36 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  44.27 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  47.2 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  36.34 
 
 		 499 aa  309  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  39.25 
 
 		 462 aa  309  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  38.33 
 
 		 495 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  36.91 
 
 		 499 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  36.67 
 
 		 499 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  36.67 
 
 		 499 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0838  stage V sporulation protein R  53.79 
 
 		 269 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08767e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0832  stage V sporulation protein R  53.96 
 
 		 269 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000211556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  37.94 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  33.54 
 
 		 478 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  33.83 
 
 		 513 aa  273  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  36.24 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  34.35 
 
 		 507 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  36.24 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  33.4 
 
 		 500 aa  259  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  32.03 
 
 		 467 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  30.64 
 
 		 520 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  30.14 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  29.7 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  31.95 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  29.92 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  30.15 
 
 		 532 aa  180  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  29.98 
 
 		 511 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  29.98 
 
 		 511 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  29.98 
 
 		 511 aa  179  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  31.63 
 
 		 517 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  30.67 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  29.8 
 
 		 517 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  31.93 
 
 		 509 aa  176  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  31.07 
 
 		 511 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  30.94 
 
 		 511 aa  176  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1029  SpoVR family protein  31.29 
 
 		 513 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  30.32 
 
 		 521 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  30.39 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1623  SpoVR family protein  30.99 
 
 		 557 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  29.49 
 
 		 520 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  30.53 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  29.47 
 
 		 516 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  30.55 
 
 		 519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  29.74 
 
 		 519 aa  173  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  31.16 
 
 		 511 aa  173  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1135  SpoVR family protein  30.44 
 
 		 507 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  30.13 
 
 		 520 aa  173  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  29.06 
 
 		 520 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1512  SpoVR family protein  30.83 
 
 		 559 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.854578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  31.52 
 
 		 513 aa  173  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  30.71 
 
 		 510 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  30.71 
 
 		 510 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  30.71 
 
 		 510 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  30.71 
 
 		 510 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  30.71 
 
 		 510 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1530  SpoVR family protein  30.83 
 
 		 559 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376164  normal  0.61215 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  30.71 
 
 		 510 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  30.25 
 
 		 502 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1615  SpoVR family protein  30.3 
 
 		 559 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  30.71 
 
 		 510 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1591  SpoVR family protein  30.3 
 
 		 559 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.762696  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  30.25 
 
 		 502 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  30.17 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2007  SpoVR family protein  31.49 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  30.42 
 
 		 521 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  30.45 
 
 		 560 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0535  SpoVR family protein  31.04 
 
 		 505 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.468104  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  30.45 
 
 		 560 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  30.45 
 
 		 560 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  30.45 
 
 		 560 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  30.45 
 
 		 560 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  30.45 
 
 		 560 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  30.75 
 
 		 511 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  30.5 
 
 		 510 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  28.97 
 
 		 507 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1227  SpoVR family protein  32.31 
 
 		 578 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  30.91 
 
 		 510 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4753  SpoVR family protein  30.18 
 
 		 559 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135349  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2255  SpoVR family protein  31.42 
 
 		 576 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  30.91 
 
 		 510 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  30.91 
 
 		 510 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  29.23 
 
 		 538 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  30.91 
 
 		 510 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  30.29 
 
 		 510 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>