141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1816 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1816  oxidoreductase/nitrogenase component 1  100 
 
 
453 aa  931    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  27.2 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  27.18 
 
 
511 aa  77  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  25.2 
 
 
516 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  25.27 
 
 
512 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4051  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  27.16 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  26.27 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  26.04 
 
 
476 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.43 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.615494  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  24.88 
 
 
454 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1788  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.43 
 
 
470 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  20.93 
 
 
477 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0407  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  21.95 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2286  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  27.82 
 
 
482 aa  64.3  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  27.6 
 
 
918 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1539  hypothetical protein  24.32 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.31 
 
 
480 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  26.8 
 
 
918 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.36 
 
 
448 aa  60.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1013  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.65 
 
 
456 aa  60.1  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153138  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  23.99 
 
 
450 aa  60.1  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4139  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.02 
 
 
936 aa  60.1  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.9 
 
 
460 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3027  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.37 
 
 
917 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4041  nitrogenase component I, alpha chain  25.76 
 
 
476 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.4 
 
 
905 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  25.27 
 
 
452 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  21.52 
 
 
402 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  25.7 
 
 
917 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2607  Nitrogenase  24.63 
 
 
501 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0234589  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1756  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.92 
 
 
453 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00502819  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1350  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.86 
 
 
455 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452769  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1249  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.7 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.265854  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.04 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.63 
 
 
454 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1632  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.44 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00463409  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  26.88 
 
 
919 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.81 
 
 
410 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  28.89 
 
 
463 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.03 
 
 
455 aa  54.3  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1052  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.95 
 
 
452 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0841  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.47 
 
 
462 aa  53.9  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  25.62 
 
 
919 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.42 
 
 
542 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.88 
 
 
487 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4796  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.68 
 
 
462 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.933705  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0680  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.96 
 
 
455 aa  53.5  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  22.37 
 
 
355 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2888  oxidoreductase/nitrogenase component 1  23.91 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2117  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.31 
 
 
467 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0140649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.99 
 
 
459 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.02 
 
 
461 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1954  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  26.44 
 
 
453 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.396368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.66 
 
 
489 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.55 
 
 
459 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  30.77 
 
 
425 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.58 
 
 
489 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3206  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  24.61 
 
 
918 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.19 
 
 
487 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  22.62 
 
 
461 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.58 
 
 
487 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  22.31 
 
 
728 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0094  Nitrogenase  25.28 
 
 
450 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.062022 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0772  nitrogenase  27.57 
 
 
451 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25 
 
 
347 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.11 
 
 
459 aa  50.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  20.99 
 
 
462 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  20.57 
 
 
460 aa  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0663  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.49 
 
 
478 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  20.75 
 
 
462 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  25.1 
 
 
919 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0313  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.06 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000260706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.28 
 
 
487 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0163  hypothetical protein  31.43 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  20.75 
 
 
462 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  19.73 
 
 
458 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.11 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  21.48 
 
 
462 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  19.73 
 
 
458 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2908  Nitrogenase  22.78 
 
 
502 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  21.6 
 
 
509 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2620  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  27.52 
 
 
474 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.18 
 
 
551 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  21.65 
 
 
461 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3096  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  27.1 
 
 
546 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.659275  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0773  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  28.32 
 
 
453 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  20.33 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0103  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.49 
 
 
480 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.21101  normal  0.23619 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  19.73 
 
 
458 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  26.67 
 
 
915 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  21.17 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1533  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.64 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.936667  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.03 
 
 
489 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.89 
 
 
542 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.44 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1798  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.49 
 
 
480 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  20.12 
 
 
489 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.96 
 
 
448 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  25.82 
 
 
467 aa  47  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>