More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1948 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1948  (2Fe-2S)-binding  100 
 
 
165 aa  342  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.03276  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0972  (2Fe-2S)-binding domain protein  72.22 
 
 
160 aa  244  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0216815  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1527  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  70.3 
 
 
166 aa  240  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.496565  normal  0.655481 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2696  (2Fe-2S)-binding domain protein  70.91 
 
 
164 aa  240  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0280354  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0528  (2Fe-2S)-binding domain protein  69.94 
 
 
171 aa  239  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0843  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  72.19 
 
 
160 aa  236  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152719 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  69.74 
 
 
185 aa  236  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.43 
 
 
163 aa  234  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2568  (2Fe-2S)-binding domain protein  66.88 
 
 
160 aa  228  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133715  hitchhiker  0.000000432495 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2184  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.1 
 
 
160 aa  225  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.30857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2765  (2Fe-2S)-binding domain protein  67.31 
 
 
165 aa  221  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00163035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4925  (2Fe-2S)-binding domain protein  68.87 
 
 
178 aa  220  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.117712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0095  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.45 
 
 
166 aa  219  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739421  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13110  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, small subunit CoxS/CutS-like protein  65.36 
 
 
181 aa  218  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  65.61 
 
 
173 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1766  (2Fe-2S)-binding  65.82 
 
 
161 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3970  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.39 
 
 
156 aa  214  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.58 
 
 
154 aa  213  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0111  (2Fe-2S)-binding protein  63.29 
 
 
161 aa  213  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0229  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.88 
 
 
181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0903003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1354  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.87 
 
 
175 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0913  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  62.66 
 
 
161 aa  210  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4351  putative carbon-monoxide dehydrogenase, small subunit (CoxS)  61.04 
 
 
176 aa  210  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0965  (2Fe-2S)-binding protein  64.2 
 
 
165 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4528  (2Fe-2S)-binding  62.66 
 
 
161 aa  210  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.261283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0449  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.05 
 
 
163 aa  208  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.583963  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0425  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  62.05 
 
 
169 aa  208  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.56858  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0645  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  61.69 
 
 
158 aa  208  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0237  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.09 
 
 
168 aa  208  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1469  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  65.99 
 
 
175 aa  207  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0370  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.35 
 
 
172 aa  207  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2001  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.45 
 
 
166 aa  207  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2660  putative carbon monoxide dehydrogenase  67.11 
 
 
162 aa  206  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175738  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1593  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.69 
 
 
165 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5147  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.03 
 
 
161 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4234  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.5 
 
 
173 aa  205  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1453  (2Fe-2S)-binding  61.15 
 
 
161 aa  204  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.422903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1379  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  60.84 
 
 
162 aa  204  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.803188  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1418  (2Fe-2S)-binding domain protein  65.52 
 
 
175 aa  204  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274063  normal  0.518826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2878  putative carbon-monoxide dehydrogenase small chain  62.26 
 
 
160 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1524  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.26 
 
 
160 aa  204  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152044  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0610  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.48 
 
 
170 aa  203  7e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.579224  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1782  (2Fe-2S)-binding  62.26 
 
 
165 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.381616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.01 
 
 
158 aa  202  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1749  (2Fe-2S)-binding domain protein  69.93 
 
 
166 aa  202  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  60.87 
 
 
165 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0574  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  61.78 
 
 
161 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4315  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.34 
 
 
184 aa  201  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5441  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.53 
 
 
166 aa  201  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4326  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.05 
 
 
161 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.399446  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1142  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.01 
 
 
160 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.442126  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3678  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  62.89 
 
 
165 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5318  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  62.89 
 
 
161 aa  200  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1220  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain- containing protein  61.69 
 
 
165 aa  200  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1763  (2Fe-2S)-binding  64.86 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2205  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase small subunit CoxS/CutS  60.38 
 
 
161 aa  198  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0357441  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4148  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.09 
 
 
157 aa  198  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.971247  hitchhiker  0.0010225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4544  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.71 
 
 
157 aa  197  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0578  (2Fe-2S)-binding  62.75 
 
 
155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1211  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.23 
 
 
163 aa  197  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103278  normal  0.545927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.23 
 
 
162 aa  197  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0058  (2Fe-2S)-binding  58.49 
 
 
161 aa  196  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.325348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20090  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, small subunit CoxS/CutS-like protein  59.33 
 
 
159 aa  196  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099649  hitchhiker  0.000822229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4664  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.33 
 
 
167 aa  196  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0075  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.77 
 
 
165 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1631  (2Fe-2S)-binding  63.4 
 
 
161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0479  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.58 
 
 
191 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2096  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  60.27 
 
 
164 aa  193  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.483624  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.09 
 
 
157 aa  192  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2145  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  60.26 
 
 
173 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.691759  normal  0.106078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1748  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  60.93 
 
 
166 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0490  (2Fe-2S)-binding protein  56.97 
 
 
191 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0501  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.97 
 
 
191 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.671579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2607  (2Fe-2S)-binding  59.75 
 
 
161 aa  190  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1563  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  55.92 
 
 
165 aa  188  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.39 
 
 
164 aa  185  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5285  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.88 
 
 
181 aa  185  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.33 
 
 
157 aa  185  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2633  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  59.72 
 
 
178 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  60.39 
 
 
164 aa  185  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.39 
 
 
164 aa  185  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  55.56 
 
 
162 aa  184  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10379  carbon monoxyde dehydrogenase small subunit  58.28 
 
 
159 aa  184  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000418965  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2532  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  62.26 
 
 
169 aa  183  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0552242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1909  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  60.62 
 
 
162 aa  184  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0223  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60 
 
 
158 aa  184  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4105  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.39 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83677  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2040  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.85 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0030  carbon monoxide dehydrogenase, small subunit  56.95 
 
 
173 aa  181  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.18 
 
 
138 aa  181  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.11 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4071  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.76 
 
 
152 aa  175  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  52.94 
 
 
164 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3026  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.98 
 
 
165 aa  174  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.513665  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4710  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.43 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.729129  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3871  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.14 
 
 
154 aa  169  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  52.94 
 
 
158 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2183  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.87 
 
 
185 aa  167  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  52.05 
 
 
155 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.73 
 
 
164 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>