More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0436 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  100 
 
 		 76 aa  147  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  80.26 
 
 		 77 aa  122  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  80.26 
 
 		 77 aa  122  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 78 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 78 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 76 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 76 aa  93.2  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 76 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 76 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 81 aa  90.5  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  61.76 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  60.87 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 76 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  60.27 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  65.15 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  58.67 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 79 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  60 
 
 		 79 aa  87.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  59.15 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 78 aa  87.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 79 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  61.11 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 76 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  59.42 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 79 aa  87  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  62.12 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  62.12 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  61.76 
 
 		 81 aa  86.7  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 76 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  59.42 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 76 aa  86.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  56.94 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  57.14 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  60.87 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 78 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 77 aa  84.3  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>