30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_R0051 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt14  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.211002 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0017  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.344367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0003  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.273312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0040  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 80 bp  67.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.850401 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0023  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 80 bp  67.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0006  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301986  normal  0.331318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0005  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  0.341408 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1053  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt10  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0075  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000964905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0015  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0036  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.977915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0072  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0065  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0064  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0082  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00186312  normal  0.0281447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0086  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0026  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344693  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0991  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0038  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>