37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2658 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2658  protein of unknown function DUF1061  100 
 
 
236 aa  490  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0294  protein of unknown function DUF1061  47.84 
 
 
234 aa  225  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3386  protein of unknown function DUF1061  43.59 
 
 
235 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3298  hypothetical protein  41.38 
 
 
235 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.910615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3305  hypothetical protein  40.95 
 
 
235 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1969  hypothetical protein  41.38 
 
 
235 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.86972 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3091  hypothetical protein  40.95 
 
 
235 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3037  hypothetical protein  40.95 
 
 
251 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.972219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3273  hypothetical protein  41.38 
 
 
235 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3313  hypothetical protein  40.95 
 
 
235 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2988  hypothetical protein  40.95 
 
 
235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000939837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3335  hypothetical protein  41.05 
 
 
229 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1043  hypothetical protein  40 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  33.78 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  33.78 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  33.78 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  33.78 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2734  hypothetical protein  33.78 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000970803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  33.78 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  33.94 
 
 
227 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  32.88 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2660  hypothetical protein  33.04 
 
 
227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2978  hypothetical protein  32.88 
 
 
227 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000992399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1553  hypothetical protein  29.82 
 
 
222 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0529  hypothetical protein  28.77 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0164114  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3446  hypothetical protein  27.6 
 
 
220 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3204  hypothetical protein  27.52 
 
 
227 aa  88.2  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0067  hypothetical protein  27.06 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5568  hypothetical protein  23.85 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.982925  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  27.38 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  23.74 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0505  hypothetical protein  23.67 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459483  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  22.4 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0909  hypothetical protein  22.22 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  23.9 
 
 
219 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  20.3 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  21.21 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>