17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2485 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2485  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  424  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4195  hypothetical protein  31.46 
 
 
226 aa  98.6  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2056  hypothetical protein  27 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685673  normal  0.507771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  26.98 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4978  hypothetical protein  30.94 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  normal  0.718613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  24.35 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1194  hypothetical protein  25.43 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0473748  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0739  hypothetical protein  28.8 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  26.51 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  24.88 
 
 
199 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  23.35 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0939  hypothetical protein  28.1 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000126087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  24.12 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  25.62 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2253  hypothetical protein  28.69 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289772  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5538  hypothetical protein  25.97 
 
 
300 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.290444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>