22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2299 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2299  hypothetical protein  100 
 
 
982 aa  2036    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3905  hypothetical protein  37.12 
 
 
965 aa  599  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164927  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1369  hypothetical protein  41.55 
 
 
868 aa  518  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.79 
 
 
1362 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1755  hypothetical protein  31.73 
 
 
975 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000113788  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4344  hypothetical protein  30.82 
 
 
966 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0662196  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0350  hypothetical protein  30.79 
 
 
1022 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0527  hypothetical protein  32.14 
 
 
981 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1833  hypothetical protein  30.69 
 
 
953 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61283  predicted protein  29.79 
 
 
997 aa  368  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0585405  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1718  hypothetical protein  31.7 
 
 
903 aa  339  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896038  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4845  hypothetical protein  33.74 
 
 
829 aa  337  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  hitchhiker  0.00200292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02750  hypothetical protein  35.17 
 
 
885 aa  323  9.000000000000001e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3877  hypothetical protein  32.5 
 
 
841 aa  320  9e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.454403  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06210  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 
1083 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0766875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1622  hypothetical protein  31.95 
 
 
970 aa  247  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09329  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 
866 aa  241  6.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1310  hypothetical protein  25.29 
 
 
735 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1577  hypothetical protein  34.36 
 
 
307 aa  128  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1578  hypothetical protein  35.24 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1618  hypothetical protein  22.09 
 
 
714 aa  81.6  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1316  hypothetical protein  30.34 
 
 
712 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>