38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1762 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  244  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1360  hypothetical protein  39.34 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5385  hypothetical protein  40.34 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003192  cytochrome P-450:NADPH-P-450 reductase  35.04 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5301  hypothetical protein  38.21 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1428  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0545971  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3211  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.750563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6703  hypothetical protein  34.96 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1604  hypothetical protein  34.15 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6227  hypothetical protein  34.15 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0274044 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6643  hypothetical protein  30.08 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174293  normal  0.0338703 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5729  hypothetical protein  36.59 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0237314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2891  hypothetical protein  28.26 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0528  hypothetical protein  26.79 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2386  hypothetical protein  25.44 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  26.36 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0198  hypothetical protein  25 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  27.27 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  27.27 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  27.43 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  27.27 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  27.27 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  27.27 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  27.27 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  27.27 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0674  hypothetical protein  26.89 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  28.32 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3057  hypothetical protein  28.45 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  28.32 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  28.32 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  24.51 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  26.5 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0150  hypothetical protein  29.7 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3183  hypothetical protein  23.85 
 
 		 119 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1879  putative secreted protein  20.69 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  25.66 
 
 		 127 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  25.21 
 
 		 143 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>