16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0051 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0051  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  1035    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286541  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4920  hypothetical protein  37.35 
 
 
506 aa  272  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404892  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6247  hypothetical protein  32.02 
 
 
499 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.594867  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4587  hypothetical protein  31.32 
 
 
467 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00650998  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4586  hypothetical protein  31.35 
 
 
480 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000082424  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1814  hypothetical protein  32.19 
 
 
494 aa  210  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835662  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4922  hypothetical protein  31.45 
 
 
513 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.741719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4860  hypothetical protein  31.8 
 
 
466 aa  199  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4585  hypothetical protein  30.66 
 
 
498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152232  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6417  hypothetical protein  28.66 
 
 
501 aa  170  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00289521  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2742  hypothetical protein  28.04 
 
 
476 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0898  hypothetical protein  26.51 
 
 
461 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1887  hypothetical protein  29.75 
 
 
452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.39427  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1976  hypothetical protein  29.18 
 
 
447 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12998  hypothetical protein  36.31 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10713  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.883584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>