23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1144 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1144  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  248  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1115  hypothetical protein  82.54 
 
 		 126 aa  207  5e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1333  hypothetical protein  82.54 
 
 		 126 aa  206  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0696  protein of unknown function DUF107  39.39 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  40.98 
 
 		 425 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  30.49 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  41.54 
 
 		 443 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_751  hypothetical protein  37.1 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0185287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  28.71 
 
 		 433 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1122  hypothetical protein  28.26 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00301074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  40.68 
 
 		 500 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  33.33 
 
 		 446 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0847  hypothetical protein  35.48 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000202964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0766  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  35.48 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.328817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  36.21 
 
 		 464 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  31.46 
 
 		 455 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  29.63 
 
 		 154 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  34.48 
 
 		 464 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  33.8 
 
 		 437 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  30.63 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0392  protein of unknown function DUF107  32.26 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2223  hypothetical protein  32.31 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  28.83 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>