22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0392 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0392  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
170 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  36.13 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  36.17 
 
 
423 aa  79  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  32.67 
 
 
436 aa  74.7  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  35.71 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0857  hypothetical protein  31.85 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
458 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1662  hypothetical protein  36.81 
 
 
493 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.174432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3229  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.255062  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  29.5 
 
 
424 aa  60.8  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1666  hypothetical protein  25.66 
 
 
235 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1632  hypothetical protein  25.66 
 
 
235 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2489  hypothetical protein  34.52 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  28.41 
 
 
828 aa  58.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  28.89 
 
 
424 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1141  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  57  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  26.8 
 
 
407 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  30.32 
 
 
447 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0326  protein of unknown function DUF107  25 
 
 
206 aa  48.1  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0124428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1663  hypothetical protein  32.93 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1144  hypothetical protein  32.26 
 
 
126 aa  40.8  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1571  protein of unknown function DUF107  37.1 
 
 
159 aa  40.8  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>