298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_R0046 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000231748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000268025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000555856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0045  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.356708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0063  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0026  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0036  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0024  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.664304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0025  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.89126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0028  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.500637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0048  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0066  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0028  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30863e-30 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0020  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0036  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0038  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.657012 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0041  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0019  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0003  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0001  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0039  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0021  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0030  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0031  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0005  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104558 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0007  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0030  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0009  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0006  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0009  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0035  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.724762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0241  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0016  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.867595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0029  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.707259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0043  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0822724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0044  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0345012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0042  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0041  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0021  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0839387  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna23  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0049  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0043  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0285317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0009  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna21  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0012  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0031  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2331  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0152091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82132  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1730  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.873105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1755  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0005  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000151844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1978  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2245  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0038  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2165  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0891  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  88 
 
 		 777 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.101452  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2253  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04003  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000136534  normal  0.315468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5683  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0251422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5728  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000760665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.34208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-9  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0690974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000170652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000219047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5815  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000650347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0022  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0027  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0036  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000594127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000064552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0022  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00428299  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0039  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0099  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5030  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000514384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0032  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5730  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0034  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5637  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>