14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2827 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2827  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  41.94 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  39.41 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  33.9 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  33.33 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  28.37 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  26.36 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  28.5 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  27.11 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  25.33 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  24.55 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>