45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1703 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1703  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  762    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1642  major facilitator superfamily transporter  46.33 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.511036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0241  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 		 405 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0694015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 409 aa  179  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1679  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  20.61 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 426 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  23.28 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  21.11 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  22.75 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  22.75 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  22.75 
 
 		 432 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 453 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  20 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.89 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  27.14 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  22.75 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  22.75 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  22.75 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  22.75 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  22.75 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  21.74 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  21.16 
 
 		 474 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>