19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3402 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3402  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  626  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1206  hypothetical protein  34.88 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.0226613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2601  putative glycosyltransferase  29.67 
 
 
290 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3248  putative glycosyltransferase  29.67 
 
 
290 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.742684 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1358  putative glycosyltransferase  23.86 
 
 
314 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3254  putative glycosyl transferase  22.37 
 
 
314 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3266  hypothetical protein  22.97 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3215  putative glycosyl transferase  22.97 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6179  hypothetical protein  22.5 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3270  hypothetical protein  24.26 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7394  hypothetical protein  23.51 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5911  hypothetical protein  21.25 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.976482  normal  0.67537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
461 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3501  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
418 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
406 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
535 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
376 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
410 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>