20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3216 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3216  nucleoside recognition domain protein  100 
 
 
341 aa  669    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3415  nucleoside recognition domain-containing protein  49.69 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0325  nucleoside recognition domain protein  58.78 
 
 
325 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0139  nucleoside recognition domain protein  48.11 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.209844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2184  hypothetical protein  49.11 
 
 
324 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1395  hypothetical protein  40.65 
 
 
316 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3717  nucleoside recognition domain-containing protein  44.74 
 
 
325 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1706  nucleoside recognition domain-containing protein  44.86 
 
 
322 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0327666  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3560  hypothetical protein  41.42 
 
 
353 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1899  nucleoside recognition  42.17 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4142  nucleoside recognition domain-containing protein  37.13 
 
 
345 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2985  nucleoside recognition domain protein  25.24 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.371702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3169  nucleoside recognition domain protein  23.93 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0326  nucleoside recognition  27.81 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0111  nucleoside recognition domain protein  39.39 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0301213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0184  nucleoside recognition domain protein  33.07 
 
 
148 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08270  nucleoside recognition domain protein  36.54 
 
 
137 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0185  nucleoside recognition domain protein  32.06 
 
 
154 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0110  nucleoside recognition domain protein  25.58 
 
 
154 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.350312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08280  nucleoside recognition domain protein  31.96 
 
 
152 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>