More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3040 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.27 
 
 
270 aa  347  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  60 
 
 
254 aa  317  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.25 
 
 
262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.87 
 
 
262 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  55.08 
 
 
259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  56.69 
 
 
257 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  56.52 
 
 
257 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.36 
 
 
262 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.69 
 
 
257 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  54.37 
 
 
258 aa  288  7e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  52.17 
 
 
265 aa  287  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.08 
 
 
257 aa  285  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.73 
 
 
257 aa  285  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  53.75 
 
 
258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  51.38 
 
 
256 aa  281  5.000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  50.59 
 
 
255 aa  281  7.000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.99 
 
 
265 aa  281  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.78 
 
 
265 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  53.17 
 
 
260 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  52.57 
 
 
276 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  54.18 
 
 
258 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.17 
 
 
267 aa  279  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.75 
 
 
295 aa  278  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54 
 
 
253 aa  278  8e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.59 
 
 
265 aa  276  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  50.99 
 
 
265 aa  276  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.99 
 
 
265 aa  276  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  50.99 
 
 
262 aa  275  4e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.94 
 
 
263 aa  275  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  52.96 
 
 
254 aa  275  5e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.59 
 
 
253 aa  274  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.33 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  50.2 
 
 
265 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  53.33 
 
 
259 aa  272  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.59 
 
 
257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.59 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.53 
 
 
314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.57 
 
 
262 aa  271  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.79 
 
 
254 aa  270  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.41 
 
 
259 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.41 
 
 
259 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.78 
 
 
300 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.22 
 
 
273 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.78 
 
 
256 aa  270  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.6 
 
 
253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  51.2 
 
 
264 aa  268  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  53.6 
 
 
294 aa  268  8.999999999999999e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  53.01 
 
 
275 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.98 
 
 
264 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  50.78 
 
 
265 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  50.78 
 
 
265 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.78 
 
 
255 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.58 
 
 
284 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  50.4 
 
 
257 aa  265  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  50.4 
 
 
257 aa  265  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  50 
 
 
253 aa  265  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.58 
 
 
284 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.38 
 
 
255 aa  263  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.96 
 
 
257 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 
262 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.58 
 
 
271 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.58 
 
 
284 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  49.61 
 
 
273 aa  263  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.59 
 
 
264 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.08 
 
 
284 aa  262  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.73 
 
 
256 aa  262  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.79 
 
 
256 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  52.24 
 
 
249 aa  261  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.98 
 
 
286 aa  261  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  51.81 
 
 
258 aa  261  6.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.97 
 
 
260 aa  261  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.58 
 
 
289 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  49.2 
 
 
262 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.2 
 
 
253 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.2 
 
 
253 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  51.2 
 
 
253 aa  260  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  53.2 
 
 
256 aa  260  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.2 
 
 
253 aa  260  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.2 
 
 
253 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.2 
 
 
253 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.39 
 
 
279 aa  260  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  50.19 
 
 
259 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 
282 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.2 
 
 
253 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.2 
 
 
253 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.22 
 
 
263 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  50.19 
 
 
283 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.79 
 
 
254 aa  259  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 
286 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.8 
 
 
253 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.79 
 
 
294 aa  259  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.8 
 
 
253 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.99 
 
 
264 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  50.8 
 
 
253 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 
286 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  51.6 
 
 
253 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 
286 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.78 
 
 
253 aa  258  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>